Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Gm20538F6Z9R1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms