Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Crocc2F6XLV1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Crocc2F6XLV1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Crocc2F6XLV1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms