Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r40F6W043 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r40F6W043 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms