Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf212F6TQD1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf212F6TQD1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms