Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Syngap1F6SEU4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms