Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm7945F6QI24 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm7945F6QI24 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms