Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pdzd7E9Q9W7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd7E9Q9W7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms