Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r152E9Q9N3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r152E9Q9N3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r152E9Q9N3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r152E9Q9N3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r152E9Q9N3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r152E9Q9N3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms