Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
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TrdnE9Q9K5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TrdnE9Q9K5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TrdnE9Q9K5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TrdnE9Q9K5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TrdnE9Q9K5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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TrdnE9Q9K5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrdnE9Q9K5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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TrdnE9Q9K5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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TrdnE9Q9K5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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TrdnE9Q9K5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrdnE9Q9K5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrdnE9Q9K5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrdnE9Q9K5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TrdnE9Q9K5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TrdnE9Q9K5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TrdnE9Q9K5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TrdnE9Q9K5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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