Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc146E9Q9F7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc146E9Q9F7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms