Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Urb2E9Q7L1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Urb2E9Q7L1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms