Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp31E9Q6Y8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms