Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga10E9Q6R1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga10E9Q6R1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms