Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FancfE9Q5Z5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FancfE9Q5Z5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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