Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BC005561E9Q5E2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BC005561E9Q5E2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms