Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20518E9Q548 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms