Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pi4kaE9Q3L2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pi4kaE9Q3L2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms