Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd1E9Q3H4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms