Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tarbp1E9Q368 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tarbp1E9Q368 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tarbp1E9Q368 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms