Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cep350E9Q309 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Cep350E9Q309 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cep350E9Q309 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms