Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hectd4E9Q2E4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms