Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc171E9Q1U1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
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