Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pdzd2E9Q1M1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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