Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myo5cE9Q1F5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Myo5cE9Q1F5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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