Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610021A01RikE9Q0Q3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2610021A01RikE9Q0Q3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms