Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930426L09RikE9Q0N7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms