Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fndc1E9Q043 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Fndc1E9Q043 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fndc1E9Q043 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms