Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx60E9PZQ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Ddx60E9PZQ1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Ddx60E9PZQ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx60E9PZQ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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