Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scaf11E9PZM7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Scaf11E9PZM7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scaf11E9PZM7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms