Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chd2E9PZM4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms