Protein–RNA interactions for Protein: E9PYW5

Vmn1r174, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r174E9PYW5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r174E9PYW5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms