Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rsph10bE9PYQ0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rsph10bE9PYQ0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms