Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptbn4E9PX29 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn4E9PX29 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms