Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931408C20RikE9PWP9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931408C20RikE9PWP9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms