Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms