Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc17E9PVB5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc17E9PVB5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms