Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc175E9PVB3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms