Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clca3bE9PUL3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms