Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl3E0CZ16 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl3E0CZ16 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms