Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC035044E0CXF8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms