Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp6ap1lD3Z5W0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms