Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L6

Slc18b1, MFS-type transporter SLC18B1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18b1D3Z5L6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc18b1D3Z5L6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc18b1D3Z5L6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms