Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptrhd1D3Z4S3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptrhd1D3Z4S3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms