Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms