Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed7D3YZZ5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed7D3YZZ5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms