Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samd1D3YXK1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Samd1D3YXK1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms