Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BC048679D3YXE9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BC048679D3YXE9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms