Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ube2d4D3YUH6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2d4D3YUH6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms