Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptprz1B9EKR1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptprz1B9EKR1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms