Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cttnbp2B9EJA2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cttnbp2B9EJA2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms